Das Museum wurde im Alten Widum, dem ältesten Haus von Fließ, eingerichtet, und im Mai 1994 eröffnet.

Nachdem im Jahre 1990 der Bauer Kathrein Josef bei Grabungsarbeiten einen bedeutenden hallstattzeitlichen Bronzehort entdeckte und 1991 der Bildhauer Erhart Kassian und der Sägewerksbesitzer Franz Neururer den prähistorischen Brandopferplatz auf der Piller Höhe entdeckten, wurde im Jahre 1992 der Museumsverein Fließ gegründet.

Im Jahre 2001 entdeckte Franz Neururer im Bereich des Moosbruckschrofens den bedeutenden mittelbronzezeitlichen Schatzfund, den man als den größten Depotfund Mitteleuropas aus dieser Zeitperiode ansehen kann.